小南山遗址是新石器时代遗址,位于黑龙江省饶河县南端乌苏里江西岸的小南山东坡上。
1971年和1991年进行两次发掘。发现墓葬1座,系二人合葬墓,为土坑竖穴式,仰身直肢葬。墓0-土有玉器、石器、牙坠饰等随葬品,玉器有块、环、珠、斧、矛、匕、簪等60余件。石器以打制为主,有矛、镞、刮削器、尖状器,还有少量磨制石器斧、镞。陶器主要有罐、钵两种,多数为素面,有少量方格拍印纹、刻划纹、篦点戳印纹。从玉器特征看,遗址的有些特征与依兰县倭肯哈达遗址近似,且与红山文化有一定的文化联系。
2019年,小南山遗址列入第八批全国重点文物保护单位。