早上跑步，不宜过早
假如清晨刚起，天还没亮，不吃东西不喝水，那么跑步对身体肯定有害无利。因为此时机体各项机能都处于低下状态，调节功能也不太稳定，生理特点决定不适合进行体育运动，原因大致有以下几点：
1、生理机能相对低下
早晨刚起时，大脑皮层尚未完全兴奋，生理机能仍处于一定的抑制状态，人体各脏器的功能相对低下。有资料显示，早3点~5点肌肉速度、力量及耐力都处于相对最差的状态。而最佳锻炼时间应在运动生理机能最佳时，此时体力、灵敏度及适应力都达到最高峰，心率血压上升最平稳，进行体育锻炼对健康最有利。而在运动机能最差时运动则易疲劳，发生运动损伤的概率也会升高。
2、体温较低
科学研究发现，体温的变化将很大程度上影响锻炼的质量和效果，即锻炼时体温越高，效果就越好。
3、血液粘稠，易发血栓
漫漫长夜没有水分摄入，而又通过皮肤、黏膜、尿液等不断丢失水分，使得晨起血液粘稠，流速减慢，发生血栓的几率增加；另一方面，运动时肌肉需血需氧量增加，粘稠的血液也不利于肌肉的供血。
4、心脏负荷大，调节功能不稳定，猝死风险增大
运动医学专家研究发现，早晨进行体育锻炼，心率和血压的上升都较下午快，心脏负担较重，易致心肌相对缺血，使运动性猝死的风险增加。美国哈佛大学医学院的研究者调查发现，每天上午6点到9点为心脏病发作的“高峰期”，因此，心脏病患者更应避免在此期间进行运动，从外界环境上讲，过早跑步也对健康不利。这是因为太阳没出来前，植物不能进行光合作用，而经过一夜的呼吸作用，空气中二氧化碳浓度较高，不适合跑步这种耗氧量较大的运动。另一方面，如果晨雾未散，雾中溶解的酸、碱、苯等有害化学物质，悬浮的尘埃以及附着于其上的病原微生物都会对呼吸道造成损伤，抵抗力低下时还会发生感染。
晚上跑步，要和晚餐、睡眠相区隔
大清早离开温暖的被窝总是让人不情愿，很多人选择在闲适的晚上跑步健身。虽然经过一天的劳作，身体已经比较疲劳，各项机能不如白天好，但只要不是太晚，依然是可以跑步的。因为对大多数人而言，八点以前机体生理功能仍较稳定良好，可以耐受跑步的强度。而且适度运动，可促进全身的新陈代谢，增进胃肠道功能，有利于食物的消化吸收。但如果太晚，就不宜进行较为剧烈的运动了。
另外，晚上跑步还需注意运动与进食、睡眠的间隔时间的关系。如果是餐前运动，最好在运动1小时后再进食。若在餐后运动，则需考虑进食量及食物种类的影响——如果进食量大且以蛋白质、脂肪为主，则饭后应至少间隔2小时再运动；而如果进食量少且以碳水化合物为主，那间隔30分钟至1小时就可以了。
临睡前，机体需要一个安静舒适的环境，且体温不能过高，以便大脑皮质进入抑制状态，使人尽快入睡。而若这时剧烈活动，则会使物质代谢加强，体温升高，大脑皮质神经元兴奋，这种状态须经较长时间的休息才能逐渐转变为抑制，这必然会延缓入睡时间，影响睡眠。因此，最好在睡前一个小时以上结束运动，以便身体各器官功能恢复平静状态。
具体实践，因人而异
然而，上述原因只是普遍规律，具体到每个人身上则另当别论。不同个体生命活动节律不同，—些人的最佳状态在太阳落山之后才呈现，而另—些人则在清晨倍感精神振奋，这些都会影响健身活动的效果。因此，最佳锻炼时间应是自己最有锻炼欲望的时间，而不必拘泥于专家怎么说。
最佳时间：上午和下午
如果真要说什么时间跑步最好，那么最受推崇的当属上午9点到10点和下午4点到6点这两个时间段。
上午9点到10点空气清新，含氧量高。体内肾上腺皮质激素水平达峰值，调动身体各器官有效发挥功能，机体各项状态相对较好，你会觉得精神集中、精力充沛、富有激情。最为重要的是此时间段处于两餐之间，运动对消化系统的不良影响最小。因为无论是饭后跑步还是跑步后立即进食，交感神经都处于兴奋状态，抑制消化液分泌及胃肠道蠕动减慢，使食物的消化吸收受影响，久而久之便会导致胃病。
而根据人体生物钟调节原理，身体的适应能力及体力的调动发挥均以下午和接近傍晚（约4点到6点）最佳，此时绝大多数人精神平静稳定，体力充盈，技术活动的灵活性、协调性、准确性及适应能力均处于最佳状态，因此在这个时间段跑步也是相当不错的选择哦。
然而现实问题是，这两个时段恰好是我们忙于工作、学习的时间。虽然身体机能状态很好，但除了专业运动员，恐怕没有多少人能有条件在这两个时段去做运动。
其实，跑步的时间并不是一个很重要的问题，跟着自己的感觉走就对了。重要的是掌握正确的运动方法，持之以恒，才能收到最好的效果。